Die Flotte der britischen Fluggesellschaft besteht hauptsächlich aus den Flugzeugtypen Bombardier Dash 8Q-400 und zwei Typen des Herstellers Embraer. Seit Gründung der Airline baut Flybe seine Flotte ständig weiter aus. Nach dem Stand von 2011 bestehen 28 offene Flugzeugbestellungen. Bei der Modernisierung der Flotte wird insbesondere darauf geachtet effiziente und umweltfreundliche Flugzeuge einzusetzen. Zur Kundenbindung und Belohnung der Passagiere hat Flybe außerdem ein Vielfliegerprogramm namens "Rewards4all" ins Leben gerufen. Personen, die an diesem Vielfliegerprogramm teilnehmen, bekommen die Möglichkeit Punkte zu sammeln und spezielle Angebote sowie Rabatte zu nutzen, wenn sie mit Flybe fliegen. Die gesammelten Punkte können dann gegen Prämien eingelöst werden.
Um seine Zeit nicht unnötig mit Warten am Flughafen zu verbringen, kann man den bequemen Online Check-in von Flybe nutzen. Damit kann man ganz einfach von zu Hause oder aus dem Zug zum Flughafen einchecken und sich seine Bordkarte sichern. Möglich ist der Check-in mit Smartphone, Tablet oder ganz herkömmlich über den PC. Den Check-in findet man unter de.flybe.com/cam/initCheckIn.do. Der früheste Zeitpunkt zum Online Check-in ist 36 Stunden vor Abflug, welchen man bis eine Stunde vor Abflug nutzen kann. Benötigt werden neben der Buchungsnummer außerdem der Name des Buchenden. Danach kann die Bordkarte ausgedruckt werden oder einfach als QR-Code auf dem Handy genutzt werden. Auch Rück- und Weiterflüge können bequem 24 Stunden vor Abflug über den Online Check-in abgewiegelt werden.
Wer nur mit Handgepäck reist, kann direkt die Sicherheitskontrollen durchlaufen und sich das Anstehen am Gepäckband sparen. Der Online Check-in an sich kann jedoch nicht von Minderjährigen, oder Reisenden in Begleitung von zwei oder mehr Minderjährigen genutzt werden. Nach dem Check-in muss man sich spätestens 15 Minuten vor dem Abflug am jeweiligen Gate einfinden, da die Buchung sonst storniert wird. Deshalb sollte man sich, auch wenn man den Online Check-in nutzt, rechtzeitig am Flughafen einfinden, um alle Sicherheitskontrollen rechtzeitig zu durchlaufen.